Gomen ne Seishun!

C'est quasiment la guerre entre les lycées Tonko et Sanjo. Situés l'un à côté de l'autre, ils fonctionnent pourtant complètement différemment. Tonko est un lycéen pour garçons, fondé sur la doctrine zen et obtenant des résultats scolaires médiocres, alors que Sanjo est un établissement catholique pour filles qui a une plutôt bonne réputation. Seulement voilà, baisse de la natalité et crise économique obligent, une fusion entre les deux écoles, vieux serpent de mer jamais concrétisé jusqu'alors, est de plus en plus d'actualité. Malgré leurs dissensions, les deux directions se mettent finalement d'accord pour effectuer un test. Le professeur Hara Heisuke et quelques élèves de Tonko sont intégrés à une classe de Sanjo tandis que la professeure Hachiya Risa et la moitié de sa classe font le chemin inverse afin de vérifier si une cohabitation est possible.