Neos contre les bêtes avancées des gemmes

Après la défaite d'Adrian, Jaden se bat contre Jesse, toujours contrôlé par Yubel. Jaden essaie de sauver Jesse en allant dans sa tête pour le retrouver sous les instructions de Neos, mais réalise que Yubel a scellé l'esprit de Jesse dans quelque chose en plus de son propre corps. Il réalise alors qu'il est enfermé à l'intérieur du Rainbow Dark Dragon. Jaden est presque vaincu mais il entend la voix de Jesse l'appeler.